Xuất khẩu có thuế GTGT đầu vào từ 300 triệu đồng được xem xét hoàn thuế

Doanh nghiệp có hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu và số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên có thể được xem xét hoàn thuế GTGT theo tháng hoặc quý. Tuy nhiên, doanh nghiệp cần đáp ứng các điều kiện về khấu trừ, hoàn thuế và xác định đúng số thuế GTGT đầu vào phục vụ hoạt động xuất khẩu theo quy định hiện hành.

Căn cứ pháp lý

• Luật Thuế giá trị gia tăng số 48/2024/QH15.
• Nghị định số 181/2025/NĐ-CP của Chính phủ.
• Thông tư số 69/2025/TT-BTC của Bộ Tài chính.
• Công văn số 6980/CT-QLNT ngày 21/9/2026 của Cục Thuế.

Lưu ý: Chính sách thuế có thể được sửa đổi, bổ sung theo từng thời kỳ. Doanh nghiệp nên đối chiếu quy định áp dụng tại thời điểm phát sinh giao dịch và hồ sơ hoàn thuế.

Doanh nghiệp xuất khẩu có thể được hoàn thuế GTGT từ 300 triệu đồng

Theo hướng dẫn mới được Cục Thuế nêu tại Công văn số 6980/CT-QLNT ngày 21/9/2026, cơ sở kinh doanh trong tháng hoặc quý có hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu, nếu số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên, thì được xem xét hoàn thuế GTGT theo tháng hoặc quý.

Quy định này được thực hiện trên cơ sở khoản 1 Điều 15 Luật Thuế GTGT số 48/2024/QH15, các quy định tại Nghị định 181/2025/NĐ-CP và hướng dẫn về cách xác định số thuế GTGT được hoàn tại Thông tư 69/2025/TT-BTC.

Tuy nhiên, mức 300 triệu đồng không đồng nghĩa doanh nghiệp đương nhiên được hoàn thuế. Đây là ngưỡng để cơ sở kinh doanh được xem xét hoàn thuế, còn việc hoàn thực tế vẫn phụ thuộc vào việc doanh nghiệp có đáp ứng đầy đủ các điều kiện theo pháp luật thuế hay không.

Những trường hợp xuất khẩu được xem xét hoàn thuế GTGT

Theo khoản 1 Điều 15 Luật Thuế GTGT 2024, cơ sở kinh doanh trong tháng hoặc quý có hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu và có số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế GTGT theo tháng hoặc quý.

Một điểm cần lưu ý là quy định hiện hành loại trừ trường hợp hàng hóa nhập khẩu sau đó xuất khẩu sang nước khác.

Như vậy, doanh nghiệp cần đồng thời xem xét các yếu tố chính:

• Có phát sinh hoạt động xuất khẩu hàng hóa hoặc cung cấp dịch vụ xuất khẩu.
• Có số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên.
• Hoạt động và hồ sơ thuế đáp ứng các điều kiện về khấu trừ, hoàn thuế.
• Không thuộc trường hợp bị loại trừ theo quy định.

Do đó, doanh nghiệp không nên chỉ căn cứ vào số thuế GTGT đầu vào trên tờ khai để kết luận mình đủ điều kiện hoàn thuế.

Các bạn có thể tham khảo thêm: 5 trường hợp được hoàn thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu

Thuế GTGT được hoàn không phải lúc nào cũng bằng toàn bộ số thuế đầu vào

Một trong những điểm doanh nghiệp cần phân biệt là số thuế GTGT đầu vào chưa khấu trừ hết và số thuế GTGT được hoàn không nhất thiết giống nhau.

Theo quy định được dẫn chiếu tại Điều 15 Luật Thuế GTGT 2024, số thuế GTGT được hoàn đối với hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu không vượt quá 10% doanh thu của hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu của kỳ hoàn thuế. Phần thuế đầu vào được xác định cho hoạt động xuất khẩu nhưng chưa được hoàn do vượt giới hạn này có thể được khấu trừ vào kỳ tiếp theo để xác định số thuế được hoàn theo quy định.

Vì vậy, doanh nghiệp cần thực hiện đồng thời việc:

Xác định thuế GTGT đầu vào → phân bổ cho hoạt động xuất khẩu → bù trừ theo quy định → xác định số thuế đủ điều kiện hoàn.

Doanh nghiệp vừa xuất khẩu vừa bán hàng trong nước cần lưu ý gì?

Đối với doanh nghiệp có cả hoạt động xuất khẩu và tiêu thụ nội địa, việc xác định thuế GTGT đầu vào phục vụ hoạt động xuất khẩu cần được thực hiện chính xác.

Trường hợp doanh nghiệp có thể hạch toán riêng, việc xác định thuế đầu vào sử dụng cho hoạt động xuất khẩu được thực hiện trên cơ sở số liệu hạch toán riêng.

Trong trường hợp không hạch toán riêng được, số thuế GTGT đầu vào liên quan đến hoạt động xuất khẩu phải được xác định, phân bổ theo phương pháp được pháp luật thuế quy định.

Đây là khâu doanh nghiệp cần đặc biệt chú ý bởi việc phân bổ sai có thể ảnh hưởng trực tiếp đến số thuế GTGT đề nghị hoàn.

Hồ sơ và chứng từ xuất khẩu cần được kiểm soát chặt chẽ

Bên cạnh việc đạt ngưỡng 300 triệu đồng, doanh nghiệp cần chuẩn bị và kiểm tra đầy đủ hồ sơ chứng minh hoạt động xuất khẩu cũng như điều kiện khấu trừ, hoàn thuế.

Tùy từng trường hợp, doanh nghiệp cần đặc biệt lưu ý đến các nhóm chứng từ như:

• Hợp đồng xuất khẩu.
• Hóa đơn và chứng từ liên quan đến hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu.
• Tờ khai hải quan đối với trường hợp thuộc diện phải làm thủ tục hải quan.
• Chứng từ thanh toán qua ngân hàng theo quy định.
• Hồ sơ chứng minh nguồn gốc, quá trình mua vào và sử dụng hàng hóa, dịch vụ.
• Hồ sơ, chứng từ liên quan đến thuế GTGT đầu vào đề nghị khấu trừ, hoàn thuế.

Việc kiểm tra tính thống nhất giữa hợp đồng – hóa đơn – tờ khai hải quan – chứng từ thanh toán – sổ sách kế toán – tờ khai thuế sẽ giúp doanh nghiệp hạn chế các vấn đề phát sinh khi cơ quan thuế kiểm tra hồ sơ hoàn thuế.

Doanh nghiệp xuất khẩu cần chuẩn bị gì để hạn chế rủi ro khi hoàn thuế?

Với các doanh nghiệp có hoạt động xuất nhập khẩu thường xuyên, việc quản lý thuế GTGT nên được thực hiện ngay từ khâu mua hàng, nhập khẩu nguyên liệu và tổ chức sản xuất, thay vì chỉ kiểm tra khi phát sinh nhu cầu hoàn thuế.

Doanh nghiệp nên xây dựng quy trình kiểm soát theo từng lô hàng hoặc từng nhóm hoạt động xuất khẩu, trong đó đối chiếu:

Chứng từ đầu vào → quá trình sản xuất/kinh doanh → hồ sơ xuất khẩu → doanh thu xuất khẩu → thuế GTGT đầu vào → số thuế đề nghị hoàn.

Đặc biệt, với doanh nghiệp vừa nhập khẩu nguyên vật liệu, sản xuất trong nước rồi xuất khẩu, việc quản lý chứng từ và hồ sơ hải quan cần được thực hiện đồng bộ với bộ phận kế toán và xuất nhập khẩu.

Lacco hỗ trợ doanh nghiệp trong quá trình xuất nhập khẩu

Đối với doanh nghiệp xuất khẩu, thủ tục hải quan và hồ sơ thuế có mối liên hệ chặt chẽ. Một bộ hồ sơ xuất khẩu được chuẩn bị đầy đủ, chính xác ngay từ đầu sẽ giúp doanh nghiệp thuận lợi hơn trong quá trình khai báo, thông quan và đối chiếu chứng từ.

Công ty Lacco cung cấp các giải pháp logistics và hỗ trợ thủ tục xuất nhập khẩu cho doanh nghiệp, bao gồm khai báo hải quan, tư vấn thủ tục xuất nhập khẩu, vận chuyển quốc tế, vận chuyển nội địa và các dịch vụ logistics liên quan.

Doanh nghiệp có nhu cầu tư vấn về thủ tục xuất khẩu, hồ sơ hải quan hoặc giải pháp logistics có thể liên hệ Công ty Lacco logistics để được hỗ trợ theo từng loại hàng hóa và tuyến vận chuyển.

Hotline: 0906 23 55 99
Email: info@lacco.com.vn
Website: lacco.com.vn

Lacco rất mong được hỗ trợ và phục vụ quý khách hàng trong các hoạt động logistics.